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[科普中國(guó)]-固氮細(xì)菌

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固氮細(xì)菌是一種能進(jìn)行生物固氮的各種原核生物的通稱,包括自生固氮菌、共生固氮菌、聯(lián)合固氮細(xì)菌三種;固氮細(xì)菌可提高土壤肥力、將一氧化碳變?nèi)剂系茸饔谩?

基本信息固氮細(xì)菌是一種能進(jìn)行生物固氮的各種原核生物的通稱,一般情況下它可分為三大類,這其中包括自生固氮菌、共生固氮菌和聯(lián)合固氮菌這三種。固氮酶對(duì)氧極其敏感,因此固氮作用必須在嚴(yán)格的厭氧條件下進(jìn)行,這對(duì)于厭氧固氮菌當(dāng)然不成問(wèn)題。但是大多數(shù)固氮菌卻是必須在有氧條件下才能生活的好氧菌,這里有一些保護(hù)固氮酶免受氧傷害的機(jī)制可以保護(hù)好。釩固氮酶通??梢詮牡?dú)庵猩砂保哉f(shuō)固氮菌可以將一氧化碳變?nèi)剂稀?/p>

分類自生固氮菌指各種自由生活、能獨(dú)立固定大氣氮的原核生物,包括多種生理類型的種類,如化能異養(yǎng)、好氧性的固氮菌屬(Azotobacter)、化能異養(yǎng)、兼性厭氧的克雷伯氏菌屬(Klebsiella)和化能異養(yǎng)、專性厭氧的巴氏梭菌(Clostridium pasteurianum),光能自養(yǎng)、好氧性的念珠藍(lán)細(xì)菌屬(Nostoc)、光能異養(yǎng)、兼性厭氧的紅螺菌屬(Rhodospirillum)和光能自養(yǎng)、專性厭氧的著色菌屬(Chromatium)等。

共生固氮菌指必須與它種生物共生時(shí)才能固氮的原核微生物。包括與豆科植物共生結(jié)根瘤的根瘤菌屬(Rhizobium)、與非豆科植物共生結(jié)根瘤的弗蘭克氏菌屬(Frankia)放線菌以及與地衣共生的魚(yú)腥藍(lán)細(xì)菌屬(Anabaena)等。

聯(lián)合固氮菌指必須生活在植物根際、葉面或動(dòng)物腸道等處才能固氮的原核生物。包括在熱帶植物根際固氮的固氮螺菌屬(Azospirillum)以及在葉面固氮的拜葉林克氏菌屬(Beijerinckia)等。所有的固氮菌都有固氮酶,在有氧障保護(hù)的嚴(yán)格厭氧微環(huán)境中進(jìn)行固氮。生物固氮對(duì)全球生物圈的存在、繁榮與發(fā)展極端重要,對(duì)人類的生存和農(nóng)業(yè)增產(chǎn)也有極其重要的作用。1

保護(hù)好氧固氮菌防止氧傷害其固氮酶的機(jī)制

固氮酶對(duì)氧極其敏感,因此固氮作用必須在嚴(yán)格的厭氧條件下進(jìn)行。這對(duì)于厭氧固氮菌當(dāng)然不成問(wèn)題。但是大多數(shù)固氮菌卻是必須在有氧條件下才能生活的好氧菌,它們是如何解決需氧但又必須防止氧傷害其固氮酶這個(gè)矛盾的呢?已知有以下一些保護(hù)固氮酶免受氧傷害的機(jī)制:

1.固氮菌保護(hù)固氮酶的機(jī)制

⑴呼吸保護(hù)

固氮菌屬的許多細(xì)菌以其較強(qiáng)的呼吸強(qiáng)度迅速耗去固氮部位周圍的氧,以使固氮酶處于無(wú)氧的微環(huán)境中而免受氧的傷害。

⑵ 構(gòu)象保護(hù)

褐球固氮菌等有一種起著構(gòu)象保護(hù)功能的蛋白質(zhì)——Fe-S蛋白質(zhì)Ⅱ,在氧分壓增高時(shí),它與固氮酶結(jié)合,此時(shí),固氮酶構(gòu)象發(fā)生改變并喪失固氮活力;一旦氧濃度降低,該蛋白便自酶分子上解離,固氮酶恢復(fù)原有的構(gòu)象和固氮能力。

2.藍(lán)細(xì)菌保護(hù)固氮酶的機(jī)制

進(jìn)行產(chǎn)氧光合作用的藍(lán)細(xì)菌普遍有固氮能力,其具有獨(dú)特的保護(hù)固氮酶機(jī)制。

分化有異形胞的絲狀細(xì)菌在異形胞中進(jìn)行固氮作用。異形胞是部分藍(lán)細(xì)菌適應(yīng)于有氧條件下進(jìn)行固氮作用的特殊細(xì)胞。它有很厚的細(xì)胞壁,缺乏產(chǎn)氧光合系統(tǒng)Ⅱ,有高的脫氫酶和氫化酶活力,這些特性使異形胞保持高度的無(wú)氧或還原狀態(tài),固氮酶不會(huì)受氧的傷害。此外,異形胞還有高的超氧化物歧化酶活力,有解除氧毒害的功能;其呼吸強(qiáng)度也高于鄰近的營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞。

沒(méi)有異形胞分化的藍(lán)細(xì)菌有的將固氮作用與光合作用分開(kāi)進(jìn)行(黑暗下固氮,光照下進(jìn)行光合作用),如織線藍(lán)細(xì)菌屬等;有的在束狀群體中央失去光合系統(tǒng)Ⅱ的細(xì)胞中進(jìn)行固氮作用,如束毛藍(lán)細(xì)菌屬;有的則通過(guò)提高細(xì)胞內(nèi)過(guò)氧化物酶或超氧化物歧化酶活力以解除氧毒害,如粘球藍(lán)細(xì)菌屬等,以保護(hù)固氮酶。

3.根瘤菌保護(hù)固氮酶的機(jī)制

與豆科植物共生的根瘤菌以類菌體形式生活在豆科植物根瘤中,根瘤不僅提供根瘤菌以良好的營(yíng)養(yǎng)環(huán)境,還為根瘤菌固氮酶提供免受氧傷害的場(chǎng)所。類菌體周圍有類菌體周膜包著,膜上有一種能與氧發(fā)生可逆性結(jié)合的蛋白——豆血紅蛋白(Lb),它與氧的親合力極強(qiáng),起著調(diào)節(jié)根瘤中膜內(nèi)氧濃度的功能,氧濃度高時(shí)與氧結(jié)合;氧濃度低時(shí)又可釋放出氧。從而既保證了類菌體生長(zhǎng)所需的氧,又不致對(duì)其固氮酶產(chǎn)生氧傷害。

非豆科植物共生根瘤菌(如共生在糙葉山麻黃根瘤中的豇豆根瘤菌)依靠非豆科植物所含的植物血紅蛋白(具有與豆血紅蛋白類似功能的蛋白)保護(hù)著固氮酶免受氧傷害。共生在赤楊、楊梅和山麻黃等非豆科植物根瘤中的弗蘭克氏屬放線菌在其營(yíng)養(yǎng)菌絲末端膨大的球形囊——泡囊中進(jìn)行固氮作用。泡囊與藍(lán)細(xì)菌的異形胞相似,有保護(hù)固氮酶免受氧傷害的功能。2

應(yīng)用固氮菌將一氧化碳變?nèi)剂?/strong>

丙烷是一種點(diǎn)燃后形成藍(lán)色火焰的氣體,全美火爐排放的氣體都含有丙烷。釩固氮酶通??梢詮牡?dú)庵猩砂???茖W(xué)家警告說(shuō),這項(xiàng)研究尚處于早期階段,不過(guò)他們同時(shí)表示,該研究最終可能會(huì)帶來(lái)全新、環(huán)保的燃料生產(chǎn)方式,最終從稀薄的空氣提取汽油。參與實(shí)施這項(xiàng)研究的美國(guó)加州大學(xué)歐文分??茖W(xué)家馬庫(kù)斯-里貝(Markus Ribbe)說(shuō):“這種微生物是一種非常常見(jiàn)的土壤細(xì)菌,我們對(duì)其已有深入了解,并且實(shí)施了長(zhǎng)期的研究?!?/p>

研究結(jié)果刊登在最新一期的《科學(xué)》雜志上。里貝補(bǔ)充說(shuō):“雖然我們?nèi)栽谘芯库C固氮酶,但我們知道這種酶具有不同尋常的特性?!笨茖W(xué)家研究的那種微生物名叫棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii),是一種對(duì)環(huán)境很重要的細(xì)菌,它通常存在于像大豆等固氮植物根部周圍的土壤中。

農(nóng)場(chǎng)主之所以對(duì)含有棕色固氮菌的植物情有獨(dú)鐘,是因?yàn)檫@種細(xì)菌可充分利用多種酶,將大氣中毫無(wú)用途的氮?dú)庾兂芍匾陌焙推渌衔?。接下?lái),其他植物吸收這些化合物,利用它們生長(zhǎng)。里貝在研究中與合作者將一種氮——釩固氮酶——隔離出來(lái),用以將氮變成氨。接著,他們從釩固氮酶中分離出氮和氧,并用一氧化碳填補(bǔ)剩余空間。

沒(méi)有了氮和氧,釩固氮酶開(kāi)始將一氧化碳變成兩到三個(gè)原子長(zhǎng)的短碳鏈。一個(gè)三碳鏈通常被稱為丙烷,這是一種點(diǎn)燃后形成藍(lán)色火焰的氣體,全美的火爐都在使用。加利福尼亞理工學(xué)院的科學(xué)家喬納斯-彼得斯說(shuō),從科學(xué)上講,釩固氮酶的新功能是一項(xiàng)“意義深遠(yuǎn)的發(fā)現(xiàn)”。

空氣變汽油還需時(shí)日

里貝說(shuō):“很顯然,如果我們可以制造出更長(zhǎng)的碳碳鏈,這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)最終會(huì)令我們開(kāi)發(fā)出合成液態(tài)燃料?!毙旅钢荒苄纬蓛傻饺齻€(gè)碳鏈,而不是構(gòu)成液態(tài)汽油的更長(zhǎng)鏈。不過(guò),里貝認(rèn)為他可以對(duì)釩固氮酶做出改動(dòng),令其可以生成汽油。如果這項(xiàng)技術(shù)得到進(jìn)一步完善,最終或能令汽車以自身排放的尾氣當(dāng)作部分燃料。而經(jīng)過(guò)更長(zhǎng)時(shí)間的研究,汽車甚至還能從空氣中“吸收”二氧化碳供其運(yùn)行的燃料,而目前已經(jīng)擁有將二氧化碳變?yōu)橐谎趸嫉募夹g(shù)。

里貝和彼得斯均表示,在近期內(nèi)還不能做到這一步。里貝說(shuō):“提取釩固氮酶的難度非常大。”由于其在農(nóng)業(yè)方面的重要性,科學(xué)家很早以前就對(duì)這種酶有了了解。他們甚至在20多年前就隔離出釩固氮酶的基因,為遺傳工程師和合成生物學(xué)家深入了解這種酶創(chuàng)造了條件。不過(guò),大量提取、生長(zhǎng)和儲(chǔ)存釩固氮酶的技術(shù)直到近幾年才開(kāi)發(fā)出來(lái),也令這項(xiàng)最新研究成為可能。在開(kāi)發(fā)出以空氣和細(xì)菌為燃料的汽車以前,科學(xué)家還必須實(shí)施進(jìn)一步研究。2

本詞條內(nèi)容貢獻(xiàn)者為:

郭亮 - 副教授 - 中國(guó)海洋大學(xué)