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明日開(kāi)播!精度優(yōu)于AlphaFold,基于深度學(xué)習(xí)實(shí)現(xiàn)生物大分子及其互作的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

HyperAI超神經(jīng)
原創(chuàng)
人工智能說(shuō)明書(shū),了解 AI 的功效和副作用。
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「Meet AI4S」系列直播第 6 期將于 1 月 15 日 19:00 準(zhǔn)時(shí)開(kāi)播,HyperAI超神經(jīng)有幸邀請(qǐng)到了南開(kāi)大學(xué)統(tǒng)計(jì)與數(shù)據(jù)科學(xué)學(xué)院教授鄭偉,他本次分享的主題是「AlphaFold3 王座未穩(wěn),來(lái)自學(xué)術(shù)界的反超:基于深度學(xué)習(xí)的生物大分子及其互作的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)」。

蛋白質(zhì)的功能取決于其獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu),近年來(lái),基于深度學(xué)習(xí)等人工智能技術(shù)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)展迅猛,AlphaFold 甚至獲得了 2024 年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。

南開(kāi)大學(xué)鄭偉教授將針對(duì)蛋白質(zhì)等生物大分子的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)歷史發(fā)展、當(dāng)前進(jìn)展進(jìn)行深度分享,并重點(diǎn)闡述其課題組開(kāi)發(fā)的蛋白質(zhì)單體 (D-I-TASSER)、蛋白質(zhì)復(fù)合物 (DMFold)、蛋白質(zhì)-核酸復(fù)合物 (DeepProtNA)、蛋白質(zhì)變構(gòu) (EnsembleFold) 等深度學(xué)習(xí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工具,同時(shí)也為大家分享其在歷屆世界蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)大賽 (CASP) 中的經(jīng)驗(yàn)。

本次直播,HyperAI超神經(jīng)還特意為大家準(zhǔn)備了 10 小時(shí) NVIDIA RTX A6000 資源,參與直播間抽獎(jiǎng)活動(dòng)的觀眾有機(jī)會(huì)免費(fèi)獲取哦!
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AlphaFold3 王座未穩(wěn),來(lái)自學(xué)術(shù)界的反超:基于深度學(xué)習(xí)的生物大分子及其互作的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

觀眾獲益

1.了解蛋白質(zhì)等生物大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的歷史發(fā)展進(jìn)程、當(dāng)前進(jìn)展及發(fā)展前景

2.了解結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)能夠如何應(yīng)用于生物學(xué)問(wèn)題及工業(yè)生產(chǎn)等領(lǐng)域

3.了解并熟悉被廣泛使用的生物大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)在線(xiàn)服務(wù)器

團(tuán)隊(duì)簡(jiǎn)介

鄭偉現(xiàn)為南開(kāi)大學(xué)統(tǒng)計(jì)與數(shù)據(jù)科學(xué)學(xué)院教授,博士生導(dǎo)師,傳染病溯源預(yù)警與智能決策全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室成員,蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)存儲(chǔ)格式 ModelCIF 國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)制定委員會(huì)成員。

他曾在密歇根大學(xué)從事博士后研究,長(zhǎng)期致力于蛋白質(zhì)等生物大分子結(jié)構(gòu)、功能及互作的預(yù)測(cè)研究,并主導(dǎo)開(kāi)發(fā)了多款精度優(yōu)于 AlphaFold2/3 的蛋白質(zhì)單體、蛋白質(zhì)復(fù)合物、核酸及復(fù)合物、蛋白質(zhì)核酸復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)算法,及結(jié)構(gòu)評(píng)估算法等,在世界蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)大賽 (CASP) 多項(xiàng)比賽中多次獲得冠軍 (CASP13-16),領(lǐng)先全球 80 余個(gè)學(xué)術(shù)/工業(yè)界課題組。曾 3 次受邀在 CASP 賽后國(guó)際會(huì)議做特邀報(bào)告。

其中,算法在CASP15的抗體-抗原復(fù)合物預(yù)測(cè)上達(dá)到了媲美實(shí)驗(yàn)解析的精度,受到 Nature 雜志的報(bào)導(dǎo)。在 2024 年舉辦的 CASP16 比賽中,其開(kāi)發(fā)的算法在蛋白質(zhì)復(fù)合物 hard 類(lèi)蛋白預(yù)測(cè)方面排名第一;在核酸多聚體方面服務(wù)器組排名第一;在蛋白質(zhì)核酸復(fù)合物預(yù)測(cè)方面排名第一;在復(fù)合物整體折疊精度估計(jì)方面排名第一。在多構(gòu)象預(yù)測(cè)方面 TM-score 排名第一。

鄭偉在Nature Methods,Nature Communications,Nucleic Acids Research, PNAS 等高水平 SCI 期刊累計(jì)發(fā)表文章 50 多篇。相關(guān)研究成果已累計(jì)獲得近 3,000 次引用,主導(dǎo)開(kāi)發(fā)的算法服務(wù)器累計(jì)服務(wù) 100 多個(gè)國(guó)家近 10 萬(wàn)名用戶(hù)。

他主持并參與了多個(gè)國(guó)家級(jí)、天津市級(jí)人才項(xiàng)目及重點(diǎn)項(xiàng)目?,F(xiàn)所在的南開(kāi)大學(xué)統(tǒng)計(jì)與計(jì)算科學(xué)學(xué)院生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì)的研究方向涉及:蛋白質(zhì)等生物大分子結(jié)構(gòu)、功能、互作預(yù)測(cè)研究;單細(xì)胞測(cè)序及組學(xué)研究;蛋白質(zhì)無(wú)序區(qū)域預(yù)測(cè)研究;大語(yǔ)言模型及生物大語(yǔ)言模型研究;抗體類(lèi)藥物篩選與優(yōu)化研究等。
Meet AI4S 系列直播

HyperAI超神經(jīng) (hyper.ai) 是中國(guó)最?的數(shù)據(jù)科學(xué)領(lǐng)域搜索引擎,聚焦 AI for Science 的最新科研成果,實(shí)時(shí)追蹤 Nature、Science 等頂級(jí)刊物的學(xué)術(shù)論文,至今已完成超 200 篇 AI for Science 論文的解讀。

此外,我們還運(yùn)營(yíng)了國(guó)內(nèi)唯一 AI for Science 開(kāi)源項(xiàng)目 awesome-ai4s。

為了進(jìn)一步推進(jìn) AI4S 的普適化,將學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的科研成果進(jìn)一步降低傳播壁壘,分享給更廣泛的行業(yè)學(xué)者、科技愛(ài)好者及產(chǎn)業(yè)單位,HyperAI超神經(jīng)策劃了「Meet AI4S」視頻欄目,邀請(qǐng)深耕 AI for Science 領(lǐng)域的科研人員或相關(guān)單位,以視頻的形式分享研究成果、方法思路,共同探討 AI for Science 在科研進(jìn)展及推進(jìn)落地過(guò)程中面臨的機(jī)遇和挑戰(zhàn),促進(jìn) AI for Science 的科學(xué)普及和傳播。

到目前為止,我們已經(jīng)成功舉辦了 4 期 Meet AI4S 直播,覆蓋地理信息科學(xué)、生命科學(xué)、蛋白質(zhì)工程領(lǐng)域。
歡迎高效課題組及研究機(jī)構(gòu)共同參與到我們的直播活動(dòng)中!添加「神經(jīng)星星」微信,了解詳情!

評(píng)論
飛馬騰空
大學(xué)士級(jí)
2025-02-04