首個(gè)桃完整泛變異組圖譜發(fā)布

4月22日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹(shù)研究所桃資源與育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)表了首個(gè)桃完整泛變異組圖譜，研究發(fā)現(xiàn)了70.6%的新變異和3289個(gè)新基因，揭示了全球桃的親緣關(guān)系和進(jìn)化路線，開(kāi)發(fā)了基因發(fā)掘新策略，實(shí)現(xiàn)了基因及功能變異的“一步定位”。相關(guān)研究發(fā)表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

該研究利用1020份桃種質(zhì)基因組數(shù)據(jù)，檢測(cè)了結(jié)構(gòu)變異等目前已知的所有變異類型，構(gòu)建了首個(gè)完整變異組圖譜，包含70.6%的新變異；構(gòu)建了泛基因組圖譜，鑒定了3289個(gè)新基因，發(fā)現(xiàn)桃馴化和進(jìn)化過(guò)程中基因數(shù)目顯著增加；解析了全球桃基因漸滲關(guān)系，重構(gòu)了全球桃傳播進(jìn)化路線，發(fā)現(xiàn)扁桃參與了山桃的形成，栽培桃最可能的直接野生祖先是光核桃，甘肅桃參與了新疆桃的形成。研究還提出了基因定位新策略GWASPV，在40個(gè)農(nóng)藝性狀、51個(gè)環(huán)境性狀和1857個(gè)代謝物性狀的基因定位中應(yīng)用，新發(fā)現(xiàn)了2000多個(gè)關(guān)聯(lián)變異，實(shí)現(xiàn)了很多性狀關(guān)鍵基因和功能變異的一步鑒定，顯著提高了基因定位和基因發(fā)掘效率，為桃分子育種提供了理論依據(jù)和基因資源。

該研究得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然基金、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院青創(chuàng)專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助。（通訊員：趙倩）